Một ngày nọ, Harry với tâm trí kết nối với Voldemort nhìn thấy người cha đỡ đầu Sirius của mình bị hắn hành hạ trong Sở Bảo Mật. Dù Hermione cảnh báo rằng Voldemort chỉ đang lừa cậu, Harry vẫn kiên quyết đến Sở Bảo Mật. Ba đứa chạy đến phòng của Umbridge để thông báo với Hội Phượng Hoàng thông qua mạng Flour, nhưng bị mụ ta phát hiện. Mụ ta yêu cầu Snape dùng Chân Dược để moi móc thông tin từ Harry, nhưng Snape nói dối rằng mụ ta đã dùng hết Chân Dược sẵn có rồi. Umbridge lại định dùng lời nguyền Hành Hạ lên Harry, nhưng Hermione nhanh trí nói rằng “vũ khí bí mật của Dumbledore” đang được giấu trong Rừng Cấm. Tại đây, Umbridge bị các Nhân Mã tóm đi vì mụ ta dám xúc phạm và còn tấn công họ. Trở về từ Rừng Cấm, Harry, Ron, Hermione, Ginny, Luna và Neville cùng đến Sở Bảo Mật để cứu Sirius. Tại đây, cả bọn thấy được lời tiên tri về Harry và Voldemort. Đúng lúc này, một nhóm Tử thần Thực tử bao gồm Lucius Malfoy và Antonin Dolohov xuất hiện tấn công. Dù chiến đấu ngang cơ với bọn chúng, cuối cùng đám học sinh vẫn bị khống chế. Đúng lúc đó, một nhóm Thần Sáng xuất hiện cùng Sirius đến giải cứu đám trẻ. Nhưng Bellatrix Lestrange từ đâu xuất hiện và găm lời nguyền Chết Chóc lên Sirius. Chứng kiến người cha đỡ đầu bị giết ngay trước mắt, Harry không giữ được bình tĩnh, tấn công Bellatrix bằng lời nguyền Hành Hạ, khiến mụ ta giãy giụa trong đau đớn. Đúng lúc đó, một giọng nói vang lên trong đầu Harry, xúi giục cậu hãy giết Bellatrix bằng lòng hận thù. Nhưng cậu nhận ra đó là giọng nói của Voldemort đang dẫn cậu vào con đường tà đạo nên đã không làm vậy. Voldemort liền xuất hiện và tấn công Harry, tạo thời cơ cho Bellatrix trốn thoát. Nhưng cụ Dumbledore kịp thời xuất hiện, giải cứu Harry và khiến Voldemort phải chùn bước. Hắn dùng Chiết Tâm Bí Thuật – pháp thuật trái ngược với Bế quan Bí thuật, giúp người dùng thâm nhập và điều khiển tâm trí kẻ khác - để điều khiển Harry. Nhưng Harry đã thành công ngăn Voldemort thao túng tâm trí cậu. Các quan chức của Bộ cũng chạy đến. Dù Voldemort nhanh chóng thoát đi trước, bộ trưởng Fudge vẫn kịp nhìn thấy hắn. Ông ta sau đó phải thừa nhận Chúa tể Hắc ám đã trở lại, và phải từ chức trong sự ô nhục. Cụ Dumbledore được phục hồi cương vị Hiệu trưởng, Lucius Malfoy bị tống vào Azkaban, và Umbridge bị sa thải khỏi Hogwarts. Khi mọi thứ yên ổn trở lại, Harry đến gặp cụ Dumbledore để hỏi về lời tiên tri giữa cậu và Voldemort. Cụ giải thích rằng lời tiên tri đó ám chỉ một đứa bé sinh vào cuối tháng 7, có cha mẹ là những người đã thách thức Voldemort ba lần sẽ là người đánh bại Chúa tể Hắc ám một lần và mãi mãi. Đứa bé đó có thể là cậu hoặc Neville, vì Neville chỉ sinh trước Harry đúng 1 ngày. Voldemort đã chọn thủ tiêu Harry trước vào đúng cái đêm định mệnh đó để trừ hậu họa. Nhưng tình yêu của mẹ Lily đã bảo vệ cậu và khiến hắn tan thành mây khói. Một năm học kinh khủng kết thúc bằng sự lạc quan. Dù Voldemort đã chính thức trở lại, Harry vẫn cảm thấy tự tin vì cậu luôn có bạn bè ở bên.