1920-tal. Docenten Herman Lundborg får i uppdrag av regeringen att bedriva rasbiologisk forskning för att säkra den så kallade svenska genhälsan och ett statligt institut upprättas i Uppsala. Under Herman Lundborgs tid som chef för institutet mätte, fotograferade, samlade och jämförde han utseenden med särskilt fokus på samer och tornedalsfinnar. Hundratusentals svenskar undersöktes och fick utså förnedring som resultat av undersökningarna, och många av deras anhöriga bär fortfarande på deras sår. Detta är berättelsen om Statens institut för rasbiologi. Sveriges Mörka Minnen görs av producent Oliver Bergman och exekutiv producent Victoria Rinkous. Manus till detta avsnitt skrevs av Tove Bolander. Vinjetten är gjord av Kristoffer Folin och uppläsare är Katarina Ewers.