À bord du Neptune, les temps sont rudes. L'équipage, qui subit un quotidien très difficile, s'évade grâce aux inombrables histoires de l'éloquent Long John Silver...

Le capitaine Edward et son second Dantzig cherchent un bateau à acquérir ainsi qu'un équipage pour leur expédition à venir. Sur le port, ils tombent sur Samir Razil, propriétaire du navire "Neptune"...

Pour reprendre en main son destin, Lady Hastings décide de rejoindre son mari aux Amériques. Avant d'entreprendre le voyage, elle se rend chez le Dr Livesey, dont elle a entendu dire qu'il aurait connu par le passé un certain marin à la jambe de bois...

L'expédition de Lord Byron Hastings découvre une cité perdue en Amazonie. Sur le vieux continent, alors que son épouse Lady Vivian lutte comme elle le peut contre la faillite de sa maison, elle apprend que son mari la dépouille de tout et l'envoie finir ses jours au couvent.

Pour éviter la faillite, Lady Vivian Hastings doit rejoindre son terrifiant époux aux Amériques et trouver la cité perdue de Guyanacapac, présumée pleine de richesses. Pour assurer ses arrières et même doubler son mari, elle entraîne avec elle le Dr Livesey et conclut un pacte avec Long John Silver, un homme connu pour son bagoût... et ses faits de piraterie.

L'heure est au rapatriement du trésor sur l'Hispaniola, en vue du voyage retour vers Bristol.

Tandis que la troupe se rapproche du butin, un chant retentit à travers la végétation et terrifie les pirates...

Les destins de Jim et Silver sont désormais liés l'un à l'autre, alors que la recherche du trésor s'apprête à débuter.

Les pirates mettent la main sur le jeune Jim. Silver lui propose de s'allier à eux.

Jim se faufile sur l'Hispaniola. Il y retrouve le pirate Israël Hands blessé, qu'il prend comme second pour l'aider à manoeuvrer le bateau.

Après l'offensive des pirates, qui fait deux morts et laisse le capitaine Smolett blessé, Jim décide de quitter le fortin.

Sous couvert du drapeau blanc, Silver rejoint le fortin pour négocier avec le capitaine Smolett.

L'affrontement a commencé ! Les pirates ont pris l'Hispaniola et les amis de Jim se sont réfugiés dans le vieux fortin de l'île. Jim doit absolument aller les retrouver.

Au beau milieu de la jungle où il s'est enfui pour échapper aux pirates, Jim fait la rencontre du très étrange Ben Gunn...

L'Hispaniola jette l'ancre. Avec l'île à portée d'exploration, la tension est palpable dans l'équipage et il devient urgent de mettre au point un plan.

Terre en vue ! Jim ne peut partager l'exaltation de l'équipage. Il sait désormais qui est réellement Long John Silver et quelles sont ses terribles intentions.

L'expédition suit son cours calmement. Jim s'est rapproché de Silver, qui se révèle fort sympathique et admirable. Quand une tempête éclate et que le second disparaît en mer, personne ne s'en étonne.

Au port de Bristol, Jim et le Dr Livesey retrouvent Trelawney à bord d'une goélette. Celui-ci a pu recruter un équipage grâce à l'aide d'un certain Long John Silver.

Les pirates pénètrent dans l'auberge à la recherche du coffre de Bill. Le trouvant vide, ils comprennent qu'un occupant de l'auberge s'est saisi de son précieux contenu.

Affaibli et remis aux bons soins de Jim, le Capitaine lui révèle craindre désormais que ses anciens compagnons ne lui envoient la Marque Noire, le pire des avertissements qu'un pirate puisse recevoir...

Un nouveau personnage pousse la porte de l'auberge : Chien Noir, une connaissance du Capitaine qui n'augure rien de bon...

La tranquilité de l'auberge "Amiral Benbow", tenue par le jeune Jim Hawkins et sa mère, est perturbée par l'arrivée d'un marin truculent et agressif. Jim comprend vite qu'il s'agit d'un pirate en fuite...