السيد ثويني بن سعيد بن سلطان البوسعيدي، تدرب على شؤون الحكم في حياة أبيه السلطان سعيد بن سلطان؛ إذ كان ينوب عنه في مسقط أثناء وجود السلطان سعيد في زنجبار وذلك منذ عام 1249هـ/ 1833م. والسيد ثويني هو الابن الثالث للسيد سعيد، ولد في عام 1235هـ/ 18٢٠م في مسقط، ولم ير زنجبار على الاطلاق كما يشير إلى ذلك المؤرخ عبدالله بن صالح الفارسي في كتابه: "البوسعيديون حكام زنجبار"، ويصفه بأنه كان نموذجا للنشاط، وعندما كبر عينه أبوه نائباً له على الأقاليم العُمانية.تزوج السيد ثويني من ابنة عمه السيدة غالية بنت سالم بن سلطان البوسعيدية سنة ١٨٣٥م، وأنجبت له السيد سالم وهو أكبر أبنائه. وله من الأبناء أيضاً: حمد وحارب ومحمد وعبد العزيز وحمدان وعلياء. ابنه السيد حمد هرب إلى زنجبار بعد مقتل والده ثويني وتولى حكم سلطنة زنجبار في عام ١٨٩٣م. فالسيد حمد بن ثويني هو خامس حاكم يتولى الحكم في سلطنة زنجبار من أسرة البوسعيد، وُلد السيد حمد في مسقط في عام ١٢٧٣هـ/ ١٨٥٦م، وهو الابن الثالث للسلطان ثويني بن سعيد، سلطان عُمان خلال الفترة (١٢٧٣-١٢٨٢هـ/ ١٨٥٦-١٨٦٦م). وقد تولى السلطان حمد الحكم في١٤ شعبان ١٣١٠هـ/ ١٨٩٣م.  توفي السلطان السيد حمد بن ثويني في ١٤ ربيع الأول ١٣١٤هـ/ ٢٥ أغسطس ١٨٩٦م. وكانت مدة حكمه ثلاث سنين وستة أشهر وتسعة وعشرين يوماً، ودفن في المقبرة الملكية بزنجبار. وابنه حارب وهو والد سلطان زنجبار السيد خليفة بن حارب بن ثويني بن سعيد بن سلطان البوسعيدي الذي يعد تاسع سلاطين سلطنة زنجبار من الأسرة البوسعيدية.يُقسِّم بعض المؤرخين حكم السلطان ثويني إلى ثلاث فترات بناء على أبرز الأحداث التاريخية المرتبطة بكل فترة: فالفترة الأولى (1840-1846م) هي أكثر الفترات التي تولى فيها الحكم على عُمان نيابة عن والده. والفترة الثانية (1856- 1861م) اشتغل فيها بمحاولات ضم زنجبار التي كانت تحت حكم أخيه ماجد بن سعيد إلى ممتلكاته. والفترة الثالثة (1861- 1865م) ركز فيها نفوذه وسلطته على مسقط.عموماً، تعد الفترة الثانية من أصعب المراحل في تاريخ عُمان؛ إذ أدى النزاع بين السلطان ثويني في عُمان وأخيه السلطان ماجد في زنجبار إلى تدخل بريطانيا بتشكيل بعثة برئاسة كوجلان لتقصي حقائق النزاع وأسبابه، فزار كوجلان مسقط وزنجبار لسماع وجهات نظر الطرفين، ثم قدم توصياته بضرورة تقسيم الدولة العُمانية إلى قسمين: آسيوي يحكمه السلطان ثويني، وإفريقي يحكمه السلطان ماجد. وقد أسند قرار التقسيم إلى كاننج نائب الملك في الهند الذي أصدر القرار في 2 إبريل 1861م/ 21 رمضان 1277هـ.وبصفة عامة عاشت عُمان فترة من عدم الاستقرار الداخلي الذي أعقب وفاة السلطان سعيد بن سلطان في عام 1273هـ/ 1856م،